W wielu firmach, które mają obowiązek wyznaczenia IOD, występują trudności organizacyjne związane z koniecznością zatrudnienia osoby posiadającej wiedzę ekspercką. Może się to również wiązać z wewnętrznymi zmianami w firmie. Warto jednak upewnić się, czy w związku z wyznaczeniem IOD nie powstał konflikt interesów.